中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部王方军

zhuxiaonan

王方军，大连化物所研究员。1982年5月出生于四川省米易县，2005年毕业于浙江大学化学系，获学士学位；2011年毕业于中国科学院大连化学物理研究所，获博士学位；2010至2011年于加拿大渥太华大学系统生物学研究所联合培养；2011年获得大连化学物理研究所破格选拔“百人计划”，任副研究员；2017年任研究员。主要研究兴趣为基于液相色谱-质谱的蛋白质等生物分子及其复合物结构和相互作用表征新方法研究。曾获2012年中国科学院优秀博士学位论文；2013年UCAS-Springer优秀博士学位论文；2014年入选中国科学院青年创新促进会。


姓名：王方军        
性别：男
类别：研究员        
学科：分析化学
职称：研究员        
学历：博士研究生
电话：0411-82464150        
Email：wangfj@dicp.ac.cn
地址：大连市中山路457号        
邮编：116023        

研究方向：
获奖及荣誉：
代表论著：
1.        Li J, Liu J, Liu Z, Tan Y, Liu X, Wang F*, Detecting Proteins Glycosylation by a Homogeneous Reaction System with Zwitterionic Gold Nanoclusters. Anal Chem. 2017, 89, 4339-4343.
2.        Zhou Y, Wu Y, Yao M, Liu Z, Chen J, Chen J, Tian L, Han G, Shen JR, Wang F*. Probing the Lysine Proximal Microenvironments within Membrane Protein Complexes by Active Dimethyl Labeling and Mass Spectrometry. Anal Chem. 2016, 88, 12060-12065.
3.        Chen J, Liu Z, Wang F*, Mao J, Zhou Y, Liu J, Zou H*, Zhang Y. Enhancing the performance of LC-MS for intact protein analysis by counteracting the signal suppression effects of trifluoroacetic acid during electrospray. Chem. Commun., 2015, 51, 14758-14760.
4.        Li J, Wang F*, Liu J, Xiong Z, Huang G, Wan H, Liu Z, Cheng K, Zou H*. Functionalizing with glycopeptide dendrimers significantly enhances the hydrophilicity of the magnetic nanoparticles. Chem. Commun., 2015, 51, 4093-4096.
5.        Liu J, Wang F*, Mao J, Zhang Z, Liu Z, Huang G, Cheng K, Zou H*. High-sensitivity N-glycoproteomic analysis of mouse brain tissue by protein extraction with a mild detergent of N-dodecyl β-D-maltoside. Anal. Chem., 2015, 87, 2054-2057.
6.        Xu B, Wang F*, Song C, Sun Z, Cheng K, Tan Y, Wang H, Zou H*. Large-scale proteome quantification of hepatocellular carcinoma tissues by a three-dimensional liquid chromatography strategy integrated with sample preparation. J. Proteome Res., 2014, 13, 3645-3654.
7.        Zhu J, Sun Z, Cheng K, Chen R, Ye M, Xu B, Sun D, Wang L, Liu J, Wang F*, Zou H*. Comprehensive mapping of protein N-glycosylation in human liver by combining hydrophilic interaction chromatography and hydrazide chemistry. J. Proteome Res., 2014, 13, 1713-1721.
8.        Wu Y, Wang F*, Liu Z, Qin H, Song C, Huang J, Bian Y, Wei X, Dong J, Zou H*. Five-plex isotope dimethyl labeling for quantitative proteomics. Chem. Commun., 2014, 50, 1708-1710.
9.        Liu J, Wang F*, Lin H, Zhu J, Bian Y, Cheng K, Zou H*. Monolithic capillary column based glycoproteomic reactor for high-sensitive analysis of N-glycoproteome. Anal. Chem., 2013, 85, 2847-2852.
10.        Wang F, Song C, Cheng K, Jiang X, Ye M, Zou H*, Perspectives of comprehensive phosphoproteome analysis using shotgun strategy. Anal. Chem., 2011, 83, 8078-8085.
11.        Wang F, Chen R, Zhu J, Sun D, Song C, Wu Y, Ye M, Wang L, Zou H*, A fully automated system with online sample loading, isotope dimethyl labeling and multidimensional separation for high-throughput quantitative proteome analysis. Anal. Chem., 2010, 82, 3007-3015.
12.        Wang F, Dong J, Jiang X, Ye M, Zou H*, Capillary trap column with strong cation-exchange monolith for automated shotgun proteome analysis. Anal. Chem., 2007, 79, 6599-6606.
专著
1.        Wang F, Applications of Monolithic Column and Isotope Dimethylation Labeling in Shotgun Proteome Analysis. Springer Theses, 2014, ISBN: 978-3-642-42007-8 (Print) 978-3-642-42008-5 (Online), DOI: 10.1007/978-3-642-42008-5.

xibei

近日，我所生物分子结构表征新方法创新特区研究组（18T5组）王方军研究员团队在超大分子量膜蛋白质复合物组成和结构动态分析方面取得新进展，通过整合化学交联质谱法和整体蛋白质组学分析，解析出光系统II复合物的动态光损伤分子机制。

　　光系统II（PSII）是光合作用过程中光依赖性反应中的第一膜蛋白复合物，是催化水的氧化产生氧气的核心。PSII复合物主要以二聚体形式嵌入类囊体膜中，每个单体含有20多种不同的蛋白质亚基，二聚体总分子量约为700kDa。虽然光是光合作用的能量来源，但是过量的光照也会造成光损伤。PSII是光损伤的关键部位，光损伤导致复合物中电子传递链失活，并造成复合物放氧活性中心的氧化损伤和放氧活性丧失。由于PSII二聚体分子量巨大，对其在光损伤过程中的组成和结构变化的动态分析极具挑战。
　　为对PSII膜蛋白复合物在光损伤过程中的组成、结构和氧化修饰变化进行全面分析，王方军团队提出了化学交联质谱法和整体蛋白质组学分析整合策略，发现这两种分析方法获得的结果高度互补、相互验证。研究显示，在光损伤早期，PSII核心蛋白亚基靠近锰簇的氨基酸残基如D2/304F和311L发生氧化，同时锰簇附近的序列区域如D2/324Q-342L首先被降解。随后，复合物电子传递链中PheoD2，QA，非血红素铁以及CP47和CP43的基质侧附近残基发生氧化，核心蛋白亚基D1，D2，CP47和CP43中发生了明显的降解和解离，外周小亚基也发生降解并最终从核心亚基上解离。研究还发现，囊腔侧结构域的主要部分在光照过程中相对稳定，并且在核心亚基降解后可能与复合物整体完全脱离。该工作对PSII膜蛋白复合物的光损伤分子机制进行了全面解析，加深了对光损伤过程的认识。
　　该工作于近日发表在中国化学会旗舰刊物CCS Chemistry上。该工作得到国家自然科学基金、辽宁省自然科学基金、我所科研创新基金等项目的资助。（文/图 周烨）

xinji

近日，我所生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与大连海洋大学赵前程教授团队合作，在HPLC-MS/MS法对热加工海参（Stichopus Japonicus）的蛋白质组学系统分析研究中取得新进展，在蛋白质水平上揭示了热加工过程中海参蛋白质的非特异水解机制，发现了高压蒸制加工方式引起的海参总蛋白损失率最低。
　　海参是我国八大海珍品之一，不仅是珍贵的食品，也是名贵的药材，具有极高的营养价值和保健功效，在《本草纲目》等多个医学典籍中都有记载。但海参极易发生自溶现象，造成海参品质劣变。因此，捕获的新鲜海参在其自溶酶激活之前必须采用热加工处理以防止自溶。目前，海参产业和学术界对热加工过程中海参蛋白质种类、数量及其水解机制的研究鲜见报道。
　　本工作中, 针对上述问题，合作团队采用蛋白质组学方法对热加工刺参的蛋白质组成（包括体壁和蒸煮液）进行了深入分析，并对三种不同热加工方法进行了比较。研究发现，尽管主要的蛋白质组成种类得以保留，但三种热加工方法导致海参体壁蛋白质的损失率皆超过10%。与常压蒸制法（APB）和常压煮制法（APS）相比，高压蒸制法（HPS）的海参总蛋白质损失率相对较低。团队进一步对热加工引起的海参蛋白质水解位点进行分析，发现热加工过程中海参蛋白质最常见的水解位点为苯丙氨酸、亮氨酸、天冬酰胺和酪氨酸，不同的热加工方法具有类似的蛋白水解机制。该研究工作从蛋白组学角度为优化海参加工工艺和提升产品的品质提供了理论依据。
　　相关成果以“Comprehensive Proteomic Analysis of Sea Cucumbers (Stichopus Japonicus) in Thermal Processing by HPLC-MS/MS”为题，发表在《食品化学》（Food Chemistry）上。上述工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连市科学和技术创新基金等项目的支持。（文/齐诗哲）
　　文章链接：https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2021.131368