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[材料资讯] 叶明亮研究员、秦洪强研究员团队建立O-GlcNAc糖肽的可逆酶促化学标记策略

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发表于 2022-4-2 16:32:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
近日,我所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)叶明亮研究员、秦洪强研究员团队与中科院上海药物所黄蔚研究员团队合作,提出并构建了O-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)糖肽的可逆酶促化学标记策略,并与亲水作用色谱富集方法相结合,实现了O-GlcNAc糖基化的高灵敏度检测,为生物样品中蛋白质O-GlcNAc糖基化的高覆盖度检测提供了一种简便有效的手段。
  O-GlcNAc修饰主要发生在丝氨酸或苏氨酸(Ser/Thr)的残基,是一种重要的蛋白质翻译后修饰(PTM),参与调控细胞代谢、信号转导、免疫应答等生理过程。由于O-GlcNAc的低丰度、高度动态变化性,极大地增加了富集与分析的难度。目前,现有的抗体等非共价作用富集策略存在亲和力低、富集效率低等问题;化学酶促标记法等富集策略虽然显著提高了糖肽富集的特异性,但是该策略引入大质量标签,降低了糖肽的鉴定效率。

糖肽

糖肽
  针对上述问题,合作团队发展了一种可逆标记的无损富集检测策略。在该策略中,科研人员首先利用糖苷内切酶突变体Endo-M N175Q的转糖酶连接活性,将N-糖链基团连接到O-GlcNAc糖单元,从而提高O-GlcNAc糖肽的亲水性;接着,基于延长糖链的亲水性,采用亲水作用色谱方法对O-GlcNAc标记糖肽进行富集;最后,利用野生型糖苷内切酶Endo-M/S的水解活性,将富集后糖肽中的标记糖链释放,实现O-GlcNAc糖肽的无痕富集,避免了标记糖链对O-GlcNAc糖肽鉴定效率的影响,以此实现了O-GlcNAc糖肽的无损富集与检测。
  合作团队将该方法应用于HeLa细胞核蛋白质O-GlcNAc糖基化的分析,从1.1mg蛋白样品中共鉴定到1414处潜在O-GlcNAc糖基化位点,其中637处(约45%)未在人源O-GlcNAc糖基化数据库中收录(1985-2020年),丰富了O-GlcNAc糖蛋白组基础数据。本工作鉴定到的O-GlcNAc糖蛋白中,包括识别RNA上N6-甲基腺苷(m6A)的YTHDF1和YTHDF3蛋白,以及与之形成相互作用网络的另外13种蛋白,后者与剧烈条件下应激小体的形成密切相关,为应激小体形成与蛋白质O-GlcNAc之间的作用机制研究提供了新线索。
  相关研究成果以“Endo-M Mediated Chemoenzymatic Approach Enables Reversible Glycopeptide Labeling for O-GlcNAcylation Analysis”为题,发表在《德国应用化学》(Angew. Chem. Int. Ed.)上。该工作的共同第一作者是我所1809组博士研究生陈尧和中科院上海药物所唐峰博士。上述工作得到国家自然科学基金、国家重点研发计划、我所创新基金、中科院青促会基金等项目的资助。(文/图 秦洪强)
  文章链接:https://doi.org/10.1002/ange.202117849


        文章来源:大连化物所
      秦洪强,山东省高密市人。2007年本科毕业于天津大学药学院,2013年获得中国科学院分析化学博士学位,指导教师邹汉法研究员。2013年留所工作,并入选中国科学院大连化学物理研究所优秀青年人才计划,破格提拔为副研究员,2018年晋升为研究员。目前,研究方向是蛋白质及其翻译后修饰的转化医学研究,主要包括蛋白质糖基化的微观不均一性分析(包括N-和O-连接糖基化),并将其应用于肿瘤干细胞、肿瘤微环境等高灵敏度分析。目前发表包括Angew. Chem. Int. Ed., Anal. Chem., Chem. Commun.等SCI论文50余篇,文章他引超过1000次。
       叶明亮,2001年8月在中科院大连化学物理研究所获博士学位,并获中科院院长特别奖。2001年年底赴美国华盛顿大学化学系从事博士后研究,主要进行生物分子的高灵敏度荧光检测与高效分离方面的研究,2003年初来到美国系统生物研究所从事高通量蛋白质组学方面的研究。2004年年底回到中国科学院大连化学物理研究所并入选中科院 “百人计划”。




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