“北京电子显微镜中心”是国家科技基础条件平台，国家大型科学仪器中心之一。中心的宗旨为“以高水平的科研带动高质量的技术服务”，主要仪器包括6台透射电镜（其中两台像差校正电镜）、3台扫描电镜、1台聚焦离子束，1台原子力扫描隧道显微镜，3台离子减薄仪，2台薄膜生长设备，全套电镜制样设备，以及多台计算工作站。中心自制了电镜的纳米力学原位测量装置，自编了多套计算软件。 
中心成员以朱静院士为学术带头人、由教授系列与实验技术系列等十余人组成。中心的研究主要分为两个方面。一是发展高分辨电子显微学、分析电子显微学、原位电子显微学，以及相关计算材料学方法，在多个尺度实现材料的微观结构与电子结构的定量分析。二是系统地研究材料中的结构演变，以及结构与性能关系。近期在实现材料的亚埃尺度表征、高空间分辨和占位分辨的定量磁结构测量、金属氧化物的表面与界面现象、催化剂的精细结构等取得创新性成果。多篇论文发表在Nature Comm.，Phys. Rev. Lett., J. Am. Chem. Soc., Angew. Chem., Adv. Mater., Acta Mater.等高水平学术期刊上。
中心密切关注涉及国计民生重大需求材料的研制，和相关单位合作，在铀分离机用高强高韧钢、航空航天材料和高速列车用钢等材料系统开展了一系列基础性研究，为我国自主研发新材料做出了贡献。
中心面向全社会开展技术服务，按照用户需求采取项目合作、测试服务和人员培训等多种方式进行。中心承担着本科和研究生课程的电子显微学理论和实验教学以及人才培养工作，十多年来，已培训国内外人员800余人。培养博士和硕士80余名，其中3名博士获全国百篇优秀博士学位论文奖。 中心的主要研究领域如下：
一、材料的显微结构与性能
铁电、铁磁、多铁材料的极化行为和界面现象；
金属催化剂与氧化物的结构与表面现象；
工程合金的显微结构调控、性能和工程应用；
自旋电子材料制备、结构和性能研究；
二、材料的电子显微学
像差校正高分辨电子显微学
高空间分辨分析电子显微学
原位电子显微学
三、计算材料科学
四、电子显微镜的附件的研制 中心管理机构：
中心管理委员会：
主任： 程建平 清华大学 教授
成员： 叶恒强 中科院金属所 院士
徐坚 中科院化学所 研究员
武晓峰 清华大学设备处 处长
甄树宁 清华大学科研院机构办 主任
李敬锋 清华大学材料学院 副院长
赵建华 中科院半导体所 研究员
于荣 清华大学 教授 中心技术委员会
主任： 叶恒强 中科院金属所 院士
副主任：朱静 清华大学 院士
成员： 李方华 中科院物理所 院士
姚骏恩 北京航空航天大学 院士
张泽 浙江大学 院士
贾春林 西安交通大学 教授
彭练矛 北京大学 教授
韩晓东 北京工业大学 教授
陈江华 湖南大学 教授
张永明 北京中科科仪股份有限公司 总裁
于荣 清华大学 教授 中心主任：于荣 清华大学 教授 中心用户委员会
主任： 赵建华 中科院半导体所 研究员
成员： 杜奎 中科院金属所 研究员
周志有 厦门大学 教授
冷小京 中国农业大学 教授
任晓敏 北京邮电大学 教授
李亚栋 清华大学 院士
罗毅 清华大学 教授 附各主要大型设备的联系方式如下：
FEI Themis 像差校正透射电子显微镜 程志英 010-62773998
FEI Titan 80-300像差校正透射电子显微镜 程志英 010-62773998
JEOL 2010F场发射透射电子显微镜 周惠华 010-62773998
FEI Tecnai G2 20透射电子显微镜 申玉田 010-62773015
JEOL 2011透射电子显微镜 王明芳 010-62773015
JEOL 2100透射电子显微镜 王明芳 010-62773015
Zeiss Auriga聚焦离子束-场发射扫描电镜 闫允杰 010-62773996
Zeiss Merlin 场发射扫描电子显微镜 闫允杰 010-62773996
Hitachi S-5500场发射扫描电子显微镜 闫允杰 010-62773996
JEOL 6301F场发射扫描电子显微镜 闫允杰 010-62773996
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